种鸭蛋自母体产出后就停止发育，外界条件不适时胚胎就会死亡，因此种鸭蛋保存必须考虑以下条件。

(一)温度在所有外界条件中，温度是最重要的条件。随着保存时间的不同，要求的温度也不同。一般保存7天以内以15-16℃，超过7天以ll℃为宜。保存温度过低，胚胎因受冻而失去孵化能力或死亡，温度过高，种鸭蛋在孵化以前就开始发育，尤其在夏季高温季节经常发现种鸭蛋在人孵前就形成血丝的情况，这样的种鸭蛋孵化率往往不高。在无公害的要求下，种鸭场或孵化厂必须在蛋库内设置空调降温和取暖设备。

(二)湿度种鸭蛋保存需要一定的湿度，以70%-80%为宜。湿度太低，种鸭蛋在保存过程中水分蒸发过多而影响孵化，湿度太高，容易滋生霉菌。

(三)通风种鸭蛋也是一种生命形式，必须保存在氧气充足的地方，因此要保证种鸭蛋库有一定的通风量，但不要有穿堂风。种鸭蛋在存放时，应防止阳光直射。种鸭蛋库内也不应有蚊蝇，否则会很容易污染种鸭蛋。

(四)种鸭蛋的存放方式要孵化的种鸭蛋不能保存在蛋箱内，因为在蛋箱内搬运过程中容易破碎，而且容易缺氧而影响孵化。专门饲养种鸭而不孵化的场家，种鸭蛋最好存放在纸制蛋盘内，而用于自己孵化的种鸭蛋要及时存放到种鸭蛋库内，并放到孵化蛋盘上存放。保存时间在天以内的种鸭蛋要大头朝上放，存放超过7天的要小头朝上，并每天翻蛋一次，以防胚盘与蛋壳粘连。

(五)保存时间在一定时间内，种鸭蛋的保存时间与孵化率成反比的关系，即保存时间越短孵化率越高，时间越长孵化率也就越低。在良好的温湿度条件下，种鸭蛋保存3一6天孵化率最好。降温和取暖条件稍差的场家，夏季保存不要超过5天，冬季保存不要超过10天，超过以上日期孵化率要急剧下降，会给生产带来不必要的损失。