在无公害蛋鸭饲养过程中对孵化的要求很严格。但传统的炕孵法、平箱孵化、桶孵等孵化鸭蛋法在条件稍微欠缺的地区也可以使用，但对消毒工作要特别加强，否则是从鸭蛋中孵化的雏鸭质童无法保证无公害生产的要求。现在还在使用传统方法孵化的厂家，在条件成熟时，一定要进行设备更新，否则随着社会对鸭产品的要求不断提高，如果不进行设备更新，将会落伍甚至被市场淘汰。对孵化厂的要求孵化厂可以作为鸭蛋生产的第一环节，是决定雏鸭质量好坏的种鸭因素以外的最重要的环节。在无公害化生产要求下，建厂时要考虑厂址、交通、水电等各方面的因素。

(一)厂址的选择

鸭蛋孵化厂是最怕污染也最容易污染养鸭场的特殊环境。因此在选址时，要首先考虑远离交通要道及其他养殖场和孵化厂，要远离人口密集区和工业区。有条件的要建立独立的孵化厂，如果一定要建在养鸭场内，则孵化厂一定与养鸭场处在主导风向的平行处，并最大限度地远离鸭场或鸭舍，一般以不少于150m为宜。孵化厂与养鸭场谁处于上风口都是不理想的。比如在华北地区，主导风向为西北一东南，那么孵化厂建在鸭场的东北或西南方向比较合适。否则鸭场或孵化厂就会存在互相影响的情况。无论在什么情况下，孵化厂必须设独立的出人口。孵化厂的规模要提前设计好，首先应考虑当地当时的市场对雏鸭的需求量，还要考虑将来孵化厂的发展。应根据每周需出雏数来确定孵化器用量，然后再确定房舍建筑面积和结构。

(二)地势选择

鸭蛋孵化厂要保证排水通畅，因此要选择地势较高的地方建场以利排水，防止洪涝灾害。

(三)水电保证

鸭蛋孵化厂用水量比较大，因为每次出雏以后都要对机器、蛋盘及出雏盘进行冲洗及消毒，大型孵化厂还要利用水降温，所以孵化厂要有足够的水量供应，并设有专用的冲洗场所。孵化厂对电力要求十分严格，在胚胎发育的关键时期偶尔的停电都会对孵化产生不可逆转的影响和损失，所以建孵化厂时，必须考虑当地的电力供应情况。在经常停电的地区必须配备自有发电设备，以保证生产的正常进行。